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完美,干货!2016年基因检测行业分析

假如是基因测序财产上游的公司,产物发卖的方针客户普遍,横跨科研、医疗、商检范畴,产物包罗测序仪、DNA提取试剂盒、捕捉试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒、上机测序试剂盒。此中测序仪、上机测序试剂盒二者是绑定的,DNA提取试剂盒、捕捉试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒是能够用第三方的产物,国内企业能够从这三个标的目的切入,可是试剂盒中的最要害的东西酶和分手材料等都仍是以进口产物为主,壁垒较高,假如能实现这两个产物的进口替换,申明企业具有较强的手艺实力。今朝全国触及基因检测概念的公司有200余家,依照营业规模划分,这些公司能够分为:

①最上游的基因检测仪器开辟企业(测序仪、芯片扫描仪、PCR装备);

②供给样本处置试剂和耗材的中上游企业(建库试剂盒、检测试剂盒、东西酶、基因芯片);

③供给第三方基因检测办事的中游企业;

④供给测序数据存储、阐发和出具陈述的下流企业;

⑤还将这三部门整合起来供给CRO办事的贸易公司

固然假如公司研发实力和经济实力答应,年夜部门公司会选择向上下流财产链延长,进一步晋升本身的盈利能力。依照基因检测公司的办事内容,首要能够分为四类:科研办事、第三方临床基因检测办事、间接面向小我的检测办事、非医疗基因检测办事(例如食物、情况、刑侦等方面的利用)。我们今天的分享的内容重点存眷的仍是基因检测在医学诊断上的应用,这个范畴受众广,附加值高,市场空间年夜。包罗以下这些方面:1、以科研的表面为患者供给医学诊断办事:

大夫在此中起主导感化,保举有需要的患者去做基因检测,大夫在此中所取得的益处是获得用药指点根据、科研数据、取得发卖提成,这是当前肿瘤基因测序遍及采取的手段,由于今朝国内只要NIPT获批临床的肿瘤高通量检测试剂盒,其他只能以科研的情势变相的进行医学诊断从而获得收益。纯科研基因检测市场在百亿级别。2、核准为病院供给检测外包办事的第三方自力医学查验尝试室:

这些机构都能展开份子诊断办事(需经由过程临检中间的PCR尝试室认证),例如QPCR、ddPCR、基因芯片等,可是高通量测序在临床检测上的利用当前遭到限制,只要在试点名单上的机构才能出具正式的临检陈述,今朝出台了第一批四个范畴的试点名单,别离是遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断、肿瘤基因测序,试点单元名单由卫计委医政医管局和妇幼司配合制订。临床基因检测的市场空间在千亿级别。3、贸易化B2C基因检测:

供给面向小我基因检测办事的贸易公司一般供给的长短诊断性基因检测,而我国有很多间接面向小我的基因检测贸易机构,营业规模乃至包罗疾病风险、先天基因、个性特点阐发等一系列基因阐发办事,将来有增强监管和整合的压力。市场空间在十亿级别。4、非医疗基因检测办事:

包罗食物、情况微生物、刑侦检测、查验检疫等方面,属在碎片化市场,触及范畴多,空间在百亿级别。1、基因检测行业的监管环境和趋向阐发

我国基因财产处在市场鼓起的早期阶段,监管束度还十分不完美,给人的感受十分紊乱。

2014年之前,我国基因测序行业处在无监管状况;

2014年2月,CFDA和卫计委叫停所有基因测序营业,对行业进行集中整理;

2014年3月,卫计委发布《关在展开高通量基因检测手艺临床利用试点单元申报工作的通知》,通知要求已展开高通量基因测序手艺,且合适申报划定前提的医疗机构能够申请试点,同时明白申请试点的基因测序项目。

2014年12月,卫计委医政医管局发布遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断这三个专业的第一批基因测序临床试点名单;

随后2015年1月,卫计委妇幼司正式核准108家医疗办事机构展开NIPT高通量测序手艺临床试点,并审核经由过程13家机构展开植入前胚胎遗传学诊断临床试点;

2015年3月,医政医管局发布了第一批肿瘤诊断与医治项目高通量测序临床试点名单。

尔后CFDA核准了几款用在高通量测序的仪器、检测试剂等。

那末基因检测财产到底由谁监管,怎样监管,监管的规模是甚么?我们做了以下梳理。

监管部分:全部基因检测行业触及细分财产浩繁,包罗病院、临检中间、仪器试剂、贸易公司、分歧的手艺平台等,所以触及的监管部分也较多。

①发改委,从宏不雅上制订基因检测财产的成长计划:

2015年6月,发改委发布《国度成长鼎新委关在实行新兴财产严重项目包的通知》,此中提到要重点成长基因检测等新型医疗手艺,并将在3年时候内扶植30个基因检测手艺利用示范中间,快速推动基因检测临床利用和基因检测仪器试剂的国产化;

另外处所发改委还介入基因检测项目标订价,例如湖南发改委订价无创产前2400元/次。

②卫计委,首要是对展开基因检测机构的天资进行审查和规范,具体由三个部门监管,别离是医政医改局、妇幼司、临检中间:

医政医改局前后发布遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断、肿瘤诊断与医治这四个专业的第一批基因测序临床试点名单,《药物代谢酶和药物感化靶点基因检测手艺指南(试行)》,《肿瘤个别化医治检测手艺指南(试行)》等规范;

妇幼司则针对产前检测在医政医改局试点名单的根本上增添了108家医疗办事机构展开NIPT高通量测序手艺临床试点,并审核经由过程13家机构展开植入前胚胎遗传学诊断临床试点;

临检中间的职责是承当临床查验质量治理与节制工作,运转全国临床查验室间质量评价打算,成立、利用临床查验参考系统,对展开基因检测办事的医学尝试室进行评估和验收。

③CFDA,对基因检测链上的仪器、试剂、阐发软件进行监管:

例如EGFR、KRAS、BRAF、C-KIT、CYP2C9、CYP2C19等基因的检测试剂盒、基因芯片等;

在高通量测序方面,CFDA前后核准了几款利用在NIPT的测序仪和检测试剂,可是在肿瘤的诊断方面,今朝还没有高通量测序仪和高通量检测试剂盒获批,试点单元只能以便宜试剂(LDTs)的情势展开检测。

手艺的监管:基因检测中的手艺平台首要有PCR(qPCR、ddPCR)、FISH(荧光原位杂交手艺)、基因芯片、测序(一代测序、高通量测序),今朝除高通量测序临床办事制定了限制政策,只要试点单元才能出具临检陈述,其他基因检测手艺,如PCR、FISH、一代测序等的利用没无限制,临检单元只需经由过程了PCR尝试室、病理学尝试室认证便可以利用这些手艺。

机构的监管:甚么样的机构可以或许展开高通量测序临床办事?除医政医改局和妇幼司发布的试点高通量基因测序手艺临床试点单元名单外,还卫计委核准的“个别化医学检测试点单元“(业内常简称为LDT试点),首批试点单元包罗中南年夜学湘雅医学查验所、北京博奥医学查验所和中国医科年夜学第一从属病院这3家机构,个别化医学检测试点的广度和范围,要高在高通量基因测序试点;另外还一些处所卫生部分所核准成立的查验所,例如“南京高新精准医学查验所”。

可是即便没有这些天资,测序办事机构也能以科研陈述的情势供给检测办事(规避医学查验的限制),或与试点病院成立结合尝试室,享受利润分成。

这些都折射出当前我国基因行业监管的不成熟,美国临检机构采纳的是CLIA/CAP认证的情势,很年夜可能我国将来也会采纳近似的认证天资。

利用范畴的监管:今朝高通量测序临床上的利用还只能试点利用在遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断和肿瘤诊断与医治四个专业标的目的。

可是在血汗管范畴、传染性疾病、肠道微生物宏基因组学等范畴,二代测序都有杰出的利用前景,当前的临床高通量测序试点只是LDT试点在某个专业标的目的的具体利用,将来利用范畴会愈来愈广。

仪器试剂的监管:由CFDA进行审批,高通量测序中需要申报的有测序仪(绑定上机试剂)、建库试剂盒、检测试剂盒、阐发软件等。

NIPT方面,CFDA前后核准了华年夜基因(BGISEQ-100基在life的Ion Torrent手艺、BGISEQ-1000基在华年夜基因之前收购的Complete Genomics的测序手艺)、达安基因(DA Proton基在life的Ion Torrent手艺)、博奥生物(BioelectronSeq 4000基在life的Ion Torrent手艺)、贝瑞和康(与Illumina合作的NextSeq CN500)的NIPT二代基因测序仪和配套试剂(13、18、21号染色体三体检测试剂盒、上机测序试剂);

在肿瘤方面,今朝今朝还没有高通量测序仪和高通量检测试剂盒获批,试点单元只能以便宜试剂(LDTs)的情势展开检测办事。

从久远来看,多方针基因panel(几十上百个基因或靶点)高通量检测试剂盒根基没有获批的可能,由于位点突变率很低,很难找到足够的病人展开临床实验,而且检测成果也没法去验证,所以这类试剂盒只能以LTDs的情势在临检尝试室利用,没法外售;

而少许方针基因(数个基因,少许突变位点)的检测试剂盒可能会被CFDA审批,可是从检测本钱来讲,少许方针基因的检测本钱不会比多方针基因检测低,所以终端价钱相差不年夜,当与多方针基因panel一路进行市场推行的时辰,其实不具有劣势。

总结:当前国内高通量测序在临床上的利用监管还很不成熟,试点名单是表面上具有出具临床查验陈述天资的机构,其实不是其他机构展开测序办事的限制前提(能以科研的情势展开办事),仪器、试剂的审批也不具有限制性,市场处在洗牌阶段,基因检����APP测公司需要积极进行两手预备,一方面准备临检天资的申报,积极结构病院终端,一方面动手仪器、试剂的审批。我国将来可能采纳和美国近似的CLIA/CAP审批,优先结构病院渠道的无望受益。案例(美国CLIA认证):

在美国,只需经由过程了CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments,临床尝试室改良法案)认证,第三方尝试室便可以按照市场需求,开辟出各类新的诊断试剂或办事,即自建项目或便宜试剂(LDTs)。

这类检测只能在该尝试室内利用,不克不及别传或出售给其他任何尝试室或医疗保健机构,从而将风险节制在无限的规模,因此不需要FDA的核准。同时,因为CLIA认证的是尝试室,所以其实不需要对每一个新办事或产物作出审批申请。病院或病人能够按照本身的需要,选择响应的诊断项目。这个政策给了第三方尝试室极年夜的自在空间,也带来了美国自力尝试室的繁华成长。

CLIA 认证最怪异的处所在在,尝试室自建项目即便在没有FDA核准的环境下,也完全能够在其尝试室规模内供给份子检测营业来指点临床。只需是有CLIA执照的尝试室,他们本身研发的制剂、手艺等也能够正当地进入临床,公道收费。

如许做的益处就是:在庞大的医疗需求、和日新月异的新手艺眼前,所有的CLIA尝试室能够跟据市场需求,快速地开辟出各类新的诊断利用。同时,美国当局没必要对目不暇接的每一个新利用做出回应。而病人能够按照本身的需要,立即获得新的诊断办事。同时FDA能够选择FDA认为真正好的诊断方式做进一步认证,并以FDA的表面发布认证,以加快FDA认为好的诊断方式在市场上的利用。申报企业只需经由过程了CLIA认证,并能包管产物的质量,那末便可以间接利用在临床上。2、基因测序的行业核心:重在办事

基因测序重在办事,很难零丁依托商品(检测试剂盒、芯片)来成立劣势,这与免疫诊断、化学发光有所分歧,由于基因检测归根结柢都是DNA一级序列的检测,与二级、三级布局无关,检测道理相对简单,都是经由过程DNA引物靶定待测序列,然后经由过程引物延长来实现序列的测定;相反,样品DNA的提取、建库和捕捉的操作却是比力繁琐,需要专业的手艺人员去操作。

上游仪器已然被少数几个公司所垄断,中上游的试剂盒产物其实不具有很高的手艺壁垒(固然假如能在建库环节和捕捉环节构成较着手艺劣势,或是开辟出效力更高的东西酶,也是很有成长前景的),并且高通量基因检测试剂盒的审批具有较年夜的不肯定性(将来可能参照美国CLIA认证的体例,具有天资的检测机构以LTDs便宜试剂的情势利用,可是欠亨过药监局的审批就没法对外发卖),病院样本量无限,进步前辈入的必定会占有诸多劣势,NIPT市场已接近饱和,肿瘤病院的争取也日益白热化,所以率先经由过程办事来抢占市场,这也许是较为稳妥的选择。

病院是不是会自行购买测序仪展开高通量测序?假如病院本身测序,那末临检测序机构必将难以合作,所以思虑这个身分是有需要的。这个问题要分隔来看,一方面斟酌用户的数目和需求,一方面斟酌测序本钱。以当前高通量测序用的最普遍的是NIPT和肿瘤诊治为例进行阐发:

在无创产前诊断范畴,我国每一年的重生儿在1500万人摆布,潜伏客户基数年夜,NIPT可以或许给出明白的诊断成果和对应的防治办法,并且成果关系到下一代的健康,检测价钱在2400元摆布,受众普遍;

另外,NIPT对测序的精度要求不是特殊高(今朝首要是针对13、18、21号染色体的三体查抄),检测是一个定量的进程,凡是采取life ion torrent平台(今朝获批的5款仪器里面3家申报的是ion torrent,并且美国已无机构采取基因芯片来做NIPT),良多年夜型病院可以或许自行展开NIPT办事,第三方测序机构的方针市场应当在中小型病院。

可是高通量测序在肿瘤范畴的利用就不太一样,我国每一年新增肿瘤患者在450万人摆布,肿瘤panel测序的价钱在8千到2万之间,并且此刻做肿瘤panel测序的患者首要目标是取得靶向药物用药指点,靶向药物价钱比力高贵(每一个月的用药开消在5万摆布),所以方针人群就加倍狭小了;

另外,肿瘤检测对测序精度要求比力高,首要针对点突变或微缺掉微反复,对手艺平台的要求高,凡是采取Illumina Hiseq/next Seq测序仪,仪器装备高贵,而且开机试剂耗材的破费高(一次开机在15万摆布),假如没有足够的样本量,根基上每次开机都是吃亏;

而且肿瘤数据的阐发比力复杂,需要特地的生物消息学人材和数据库,所以在肿瘤范畴(在其他病患更少的范畴更是如斯),我们认为高通量测序仍是以第三方临检机构为主,方针市场在年夜型病院。3、基因测序公司(NGS)的成长标的目的:测序是出发点而不是起点

假如是基因测序财产上游的公司,产物发卖的方针客户普遍,横跨科研、医疗、商检范畴,产物包罗测序仪、DNA提取试剂盒、捕捉试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒、上机测序试剂盒,此中测序仪、上机测序试剂盒二者是绑定的,DNA提取试剂盒、捕捉试剂盒/多重子扩增试剂盒、建库试剂盒是能够用第三方的产物,国内企业能够从这三个标的目的切入,可是试剂盒中的最要害的东西酶和分手材料等都仍是以进口产物为主,壁垒较高,假如能实现这两个产物的进口替换,申明企业具有较强的手艺实力。

在科研和商检范畴,试剂盒的审批门坎较低,可是需要供给定制化办事;在医疗诊断范畴,多基因的捕捉试剂盒/多重子扩增试剂盒不年夜可能经由过程CFDA审批(前面已申明缘由),只要经由过程认证的临检尝试室才可以或许以便宜试剂利用,是以这部门企业(思绪迪、世和基因、燃石生物等)需要做两手预备,准备扶植临检中间,向办事端结构。

测序是出发点而不是起点,做中游测序办事的机构,最年夜的市场仍是在医疗诊断范畴,除经由过程供给办事取得收益外,测序机构最年夜的潜伏劣势是可以或许取得非凡患者的组织样本,而且取得基因数据的堆集,这对药物开辟是十分便当的前提。

好比说,肿瘤患者在利用某靶向药物后呈现耐药性,测序机构经由过程基因测序发觉了新的耐药位点(这是PCR、基因芯片这类检测已知突变位点的手艺所不具有的劣势),那末这个位点就是下一款靶向药物的开辟标的目的,而且测序机构还能够取得患者的肿瘤组织,以此培育原代细胞株,作为药物开辟的细胞模子,这就比其他的药物研发机构具有更多的先发劣势。

我小我看好思绪迪的成长模式,以本身的测序办事为桥梁,买通患者、病院、CRO企业,测序成果供给用药指点,同时反过来链接下流药物开辟和临床实验,构成杰出的反馈机制。案例(美国肿瘤测序公司Foundation Medicine):

Foundation Medicine是一家专注在肿瘤高通量测序的贸易公司,该公司专有的平台可发生对病人的个别癌症可操作的基因组消息,使大夫可以或许在临床实践中优化医治,使生物制药公司制订有针对性的癌症疗法加倍有用。

该公司以二代基因测序手艺为根本,按照癌症基因测序成果给肿瘤患者供给精准的用药指南。该公司的基因测序手艺可以或许发觉导至患者罹患癌症的基因突变,让“个别化用药”走进了新范畴,让大夫可以或许按照患者的遗传消息进行有针对性的癌症医治。

Foundation Medicine的办事需要大夫订购,患者只需供给10余个病例组织切片或一管几毫升的血液。从提取肿瘤细胞的DNA到终究的陈述,延续时候14-21天,此中包括了检测出来的癌症基因突变环境,和针对每种突变基因给出的用药指点建议。

Foundation Medicine供给两种产物,FoundationOne和FoundationOne Heme。两种产物均是以二代基因测序为根本,利用的测序仪包罗Illumina HiSeq 2000 system和 Life Technologies' Ion Torrent。FoundationOne检测合用在所有实体瘤,检测315个癌症相干基因的编码区域和28个基因的内含子重排,费用为美金5800。FoundationOne Heme检测针对血液恶性疾病、淋巴瘤、白血病等,检测405个基因的编码区序列和31个基因的内含子重排,和265个基因的RNA序列来检测基因融会,费用为美金7200。FoundationOne检测的方式在2013年10月时颁发在了Nature Biotechnology上。

进行癌症基因测序检测需要癌症基因的数据库,公司因此成立了数据库FoundationCORE。公司在2014年12月推出了阅读器ICE 2,该阅读器的一年夜特点是“患者婚配”功能。临床大夫能够经由过程它在已有的常识库FoundationCORE中搜刮,寻觅与患者肿瘤基因组近似的其他患者的消息。ICE 2的一个新的构成部门是PatientMatch,是一种操纵FoundationCORE来增添FoundationOne和 FoundationOne Heme利用率的手艺东西。经由过程PatientMatch,利用ICE 2收集的大夫能够与在医治具有近似基因材料病人的大夫相联系,和他们分享诊断成果合医治方案。按照公司2015年第三季度的陈述,FoundationCORE已包括6万个临床病例消息。

Foundation Medicine一向在尽力的一个范畴是医保问题。2014年,密歇根州的年夜溪城重点卫生部分公布把Foundation Medicine的癌症基因组阐发办事纳入医保规模;Google暗示谷歌公司将该公司的癌症基因的DNA检测办事,作为其员工福利打算的一部门。Foundation Medicine还经由过程了McKesson诊决绝易所和美国国度分析癌症收集的承认,可以或许对非小细胞肺癌进行全基因组检测,而且收到了怪异的Z-code标识符。另外,Foundation Medicine首席财政官Jason Ryan暗示,医保规模不但在肺癌中慢慢扩年夜,还将会慢慢触及到其他疾病办事。

Foundation Medicine的停业收入首要来自两个方面,一个是来自生物制药公司,另外一个是来自临床诊断。2015年第三季度,来自生物制药公司的收入为1170万美元,与客岁同期比拟增加75%;来自临床诊断的收入为1370万美元,与客岁同期比拟增加40%,营收增加很是较着。

【来历:静夜思财经】

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